中國農(nóng)業(yè)科學院茶葉研究所開發(fā)出首款茶樹高密度SNP芯片

中國農(nóng)業(yè)科學院茶葉研究所開發(fā)出首款茶樹高密度SNP芯片

36閱讀 2021-12-11 01:41 快訊

近日,中國農(nóng)業(yè)科學院茶葉研究所茶樹遺傳育種團隊基于‘龍井43’基因組參考序列和茶樹重測序數(shù)據(jù),開發(fā)出一款200K茶樹SNP芯片。

該芯片是首款茶樹高密度SNP芯片,以‘龍井43’(♀)和‘白毫早’(♂)F1群體為材料,該芯片能夠?qū)?8226個SNP位點繪入圖譜,獲得5325個bin-marker,連鎖圖譜總長度為2107.01cM,相鄰標記平均遺傳圖距為0.39cM,構(gòu)建了目前遺傳密度最高的連鎖圖譜。

實驗驗證表明,該芯片可以有效定位關(guān)鍵QTL位點,發(fā)掘茶樹重要功能基因。利用其對不同茶樹品種的SNP分型研究,發(fā)現(xiàn)茶樹大葉種和小葉種之間的兩個強選擇位點,這為揭示茶樹品質(zhì)調(diào)控關(guān)鍵基因和兩個變種間的進化關(guān)系有重要意義。

相關(guān)論文以“Development of a genome-wide 200K SNP array and its application for high-density genetic mapping and origin analysis of Camellia sinensis”為題,發(fā)表在植物學領(lǐng)域頂尖期刊Plant Biotechnology Journal 雜志上。

中國農(nóng)業(yè)科學院茶葉研究所為該論文第一完成單位,韋康研究員、王新超研究員等為共同第一作者,成浩研究員、王麗鴛研究員為共同通訊作者。麗水市農(nóng)林科學研究院、云南省農(nóng)業(yè)科學院茶葉研究所等單位也參加本研究。本研究得到了國家重點研發(fā)項目、院創(chuàng)新工程、國家自然科學基金和浙江省農(nóng)業(yè)新品種重大選育專項等項目的支持。

來源:湖北茶葉

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